挑选崖柏手串时，可以选择太行出产的崖柏或者南方崖柏。同时细细观察崖柏花纹，雀眼和瘤疤纹的品质较佳，不过这两种纹路很容易混淆。也可以闻闻崖柏手串的香味，有松香混合药香的崖柏是真品。
崖柏手串的材料的产地不同，品质也不同。它的产地可分为：太行崖柏、四川崖柏、西藏崖柏等，其中以太行崖柏的手串最佳。另一种分类为北方崖柏和南方崖柏，崖柏在北方生长的速度比在南方要慢，所以选择南方崖柏制做手串不易开裂。
崖柏手串的花纹分为雀眼、瘤疤、云纹、火焰纹、水波纹、黑线、阴阳。其中雀眼属珍品，雀眼越小，价格越高。再者是瘤疤，它是崖柏在生长过程中形成的，类似树瘤，不过要注意挑选时，不要混淆瘤疤和雀眼。
挑选崖柏手串时可以闻一闻它的香味，崖柏中含有挥发油、黄酮类化合物、酶类化合物等多种有益人体的物质，有止咳祛痰、抗氧抑菌的功效，因此真正的崖柏有一股松枝香混合药味的香味，而假的崖柏则没有。
