在给金刚菩提去皮的时候，首先用刀子把外皮大体上削一遍，再放在温水中浸泡几个小时，这样可以软化里面的残渣。用钢丝刷刷洗一次，之后放在清水里泡洗，将其擦干后重新干刷一次，才可以放在手上盘玩。
金刚菩提是一种植物的果实，刚买来的金刚菩提表面多少会有一些外皮，此时可先用小刀将外皮大体上削一遍，但不可将里面的纹路削掉，以免影响它的美观性，再将其放在水中浸泡几个小时，以起到软化的效果。
将金刚菩提泡洗的时候，主要以温水为主，不可使用热水，也不宜加入任何的清洁剂，主要以干洗为主，用钢丝刷仔细的刷洗一次，由于钢丝刷比较坚硬且细密，能将最深处的污垢清洁出来，同时还能形成天然的打磨效果。
待表面清洗干净后，再放在清水中浸泡半个小时，用手在里面不停的搅拌，这样能将里面的渣滓清理出来，再用水冲洗干净后，放在阴凉处的环境中晾干，之后再进行重新干刷一次，以达到深度清洁的效果。
