当小金刚菩提上有灰尘时，这时候要用硬毛刷将每个缝隙都要刷几次，将里面的污垢清理出来。或者先放在水里泡一会儿，再用钢丝刷仔细刷洗，之后捞起来晾干后重新干刷几次，这样有利于上色，还能增加表面的色泽。
当小金刚菩提上有灰尘的时候，长时间盘玩后会容易引起一定的色差，最好的方式就是要多刷，主要以干刷为主，这样能将里面的渣滓清理出来，刷的时候要将每个缝隙都要刷到位，以利于更好的上色。
对于新买来的小金刚菩提来说，里面不仅有灰尘，还会残留一些果肉和果皮，此时可将其放在温热水中浸泡2～3个小时，以软化里面的残渣，用钢丝刷挨个的刷洗，一边转动一边刷，之后换水浸泡，用手不停的搅拌。
当搅完后，将其捞起来放在干毛巾上仔细搓揉，将里面的污垢清理出来，之后放在阴凉的背光出晾干，等它完全干透后再用猪毛刷干刷几次，这样能达到深度清理的效果，还能有助于包浆的形成，盘玩的效果也会更好。
