在清洗菩提子期间，首先将其放在温热水中浸泡一个小时，将里面的碎屑泡软后，用钢丝刷仔细将每个部位刷洗干净。之后换水浸泡，用手在水里不停的搅拌，捞起来晾干后，用猪毛刷再干刷几次即可。
在清洗菩提的时候，首先要将其放在温热水中浸泡一个小时左右，这样能将里面的果皮碎屑泡软，清理起来比较方便，同时采用泡水清洗时，能将里面损坏的或者颜色不一致的挑选出来，以免影响最佳的盘玩效果。
之后用钢丝刷或者钩针将里面的残渣清理出来，刷的话主要以垂直的角度平刷，还要将每个缝隙都要刷到位，刷洗几次后换水浸泡，用手在里面不停的搅拌，这样能将污垢洗出来，将其捞起来后擦干上面的水分。
此时不要直接放在阳光下暴晒，以免出现干裂的现象，主要以阴干为主，待其完全干透后，再用猪毛刷重新干刷几次，这样能对表面起到一定的打磨效果，还能达到深度清洁的作用，盘玩起来也会更有手感。
