若是在平时很少清洗，导致里面的污垢积累出现发黑的现象时，最好要将其放在温热水中泡洗，再用钢丝刷将每个部位仔细刷洗干净，再进行阴干处理。如果双手很脏导致表面发黑，可在每次盘玩前将双手洗干净，或者戴一个手套盘玩。
菩提子表面会有很多大小不一的裂纹，若是在平时很少清洗，里面的污垢和灰尘长期积累，就容易出现发黑的现象，这时候可将菩提子放在温热水中泡洗，用钢丝刷将里面发黑的部位仔细刷洗几次，再放在阴凉处晾干。
很多人在盘玩菩提子的时候，没有将双手洗干净就直接上手盘玩，盘玩的时间长了，也容易出现发黑的现象，最好每次盘玩前要将双手洗干净，也不要涂抹任何的护肤品，如果嫌麻烦的话，可以戴一个专用的手套进行盘玩。
菩提子最佳的盘玩方式就是要多盘多刷，如果长期上油保养的话，容易导致内部结构失去水分，时间长了表面也容易出现发黑的现象，最好在平时避免经常油养，将其多放在手心上盘玩，夏天出汗多的时候适当盘久一点即可。
