可以将菊花石上油保养，让菊花石慢慢吸收油分，从而达到保养效果。也可以经常对菊花石补充水分，使菊花石保持光亮的色泽。或者将菊花石握在手中盘玩，长期以往让菊花石的表面形成包浆，以提高菊花石的价值。
上油保养主要适用于硬度较高且质地细腻的菊花石，比如彩色菊花石。在对菊花石进行上油保养之前，需将菊花石清洗干净病晾干，而后再进行上油，让菊花石慢慢吸收油分。保养菊花石的油建议使用白茶油，橄榄油次之、茶油再次之、花生油为下。
水养适合于大中型的菊花石。菊花石一经挖掘离开地表，会使得菊花石中的水分流失，因此需要对菊花石进行补水。菊花石通过每日浇水或浸泡，可补充菊花石里的水分，进而保持其光亮的色泽。
将菊花石日日握在手中盘玩，让菊花石受到人体所分泌的油脂的摩擦养护，可使菊花石的表面形成一层包浆，从而散发出沉静内敛的光泽，使菊花石具有更好的价值。
