玛瑙的主要成分是二氧化硅，而玉的主要成分是含水的钙镁硅酸盐。玛瑙的颗粒分布比较均匀，而玉的颗粒分布不均。玛瑙的颜色比较丰富多样且层次分明，而玉比较单一。玛瑙多为半透明或不透明，质地坚硬，而玉石的透明度比玛瑙高，更适合雕刻。
玛瑙和玉的化学成分不同。玛瑙的主要成分是二氧化硅，而玉的主要成分是含水的钙镁硅酸盐。玛瑙和玉的颗粒分布也不同，玛瑙的颗粒分布和颜色分布都比较均匀，而组成玉的颗粒大小不一，并不均匀，所以质地好的玉石比较罕见。
玛瑙的颜色比较丰富绚丽, 有红色、蓝色、黑色、绿色、白色、灰色、淡黄色等，且层次分明，有明显的条带状花纹。而玉的颜色比较单一，没有玛瑙那么多彩。
玛瑙多呈半透明或不透明，而玉石通明透亮，比玛瑙的透明度高。且玛瑙质地坚硬，比较难雕刻，而玉石上可以雕刻出比较细的线条。
