玛瑙是脱水二氧化硅的胶凝体混有隐性晶体结构石英构成，一般会以致密块状呈现，主要有乳房状、葡萄状、结核状等各种构造。而玉髓是隐晶质结构的石英，通常会以乳状或钟乳状呈现。玛瑙整体而言比玉髓好，因为玛瑙中的南红玛瑙可以达到玉石级。
1、透明度不同
透明度不同时玛瑙和玉髓主要的区别之一，玛瑙是由脱水二氧化硅的胶凝体混有隐性晶体结构石英构成，而玉髓是隐晶质结构的石英，因此玉髓的通透性比玛瑙更好。
2、形状不同
此外玛瑙和玉髓的区别还在于形状不同，玛瑙经常呈现致密块状并形成乳房状、葡萄状、结核状等各种构造，而玉髓主要以乳状或钟乳状产出。
玛瑙整体而言比玉髓更好，因为玛瑙中的南红玛瑙可以达到玉石级，这种玛瑙非常珍贵、稀有，收藏价值比所有玉髓都要高。
