玛瑙多为半透明状，可以呈现红、绿、白、黄、黑、蓝等多种颜色，它属于属于隐晶质结构，不能看到内部结晶体的颗粒。而翡翠从不透明至全透明都有，颜色以绿色为主，此外也有墨色、碧色、黄色等颜色，内部晶体属于纤维交织状结构。
质地不同是玛瑙和翡翠主要的区别之一，玛瑙多为半透明状，打光后外观似透非透，吃光不透光，有一种胶质感，两块玛瑙碰撞后会发出沉闷的声音。而翡翠的质地通透，打光后有种玻璃质感，两块翡翠碰撞会发出清脆的声音。
从玛瑙和翡翠的色泽来看，玛瑙的颜色非常丰富，可以呈现红、绿、白、黄、黑、蓝等多种颜色，并且玛瑙有特有的玛瑙纹。而翡翠的颜色总体偏于绿色，此外也有墨色、碧色、黄色等颜色。
从玛瑙和翡翠的物理性质来看，玛瑙属于隐晶质结构，不能看到内部结晶体的颗粒。而翡翠属于集合体矿物，它的成分相对较复杂，大部分翡翠可以看到食盐一样的小颗粒。
