玉髓主要可以从颜色、通透度、整体成色等方面鉴别。天然的玉髓颜色通常不会过于明艳，有很好的通透性，而人工处理过的过于鲜艳亮丽，通透度不高。假玉髓颜色过于统一，且缺乏深浅变化。颜色罕见的玉髓，如蓝色、紫色，多为人工染色，不建议购买。
经人工热处理过的玉髓颜色会过于鲜艳亮丽，但通透度不高。天然的玉髓通常不会有过于明艳的颜色，但有很好的通透性，优质玉髓的通透度可以媲美翡翠的玻璃种。
在购买玉髓手串时，可以根据成色鉴别真假。从整体上看，假玉髓手串中每一颗的颜色都几乎相同，颜色过于统一。从单颗成色上看，假玉髓成色过于均匀纯净，缺乏颜色的深浅变化。
颜色过于少见的玉髓也不建议购买。比如说蓝色的、紫色的玉髓，多为人工染色形成，不是天然的。红玉髓实际上的颜色是橙色，所以看到深红色的玉髓也需要谨慎购买。
