碧玺与水晶的结构成分不同，碧玺的结构成分较为复杂，晶体呈球面三角形，水晶由二氧化硅构成，晶体呈六棱柱状。颜色也不同，碧玺的颜色因金属离子相互影响的作用而丰富多样，而水晶的颜色以白色为主。
碧玺
碧玺化学成分复杂，受热具有压电性与热电性，因此被称为电气石，为硅酸盐类矿物，所组成的晶体为三方晶系，呈球面三角形，表面为纵纹。水晶属于宝石类，为二氧化硅矿物，晶体呈六棱柱状，断口为贝壳状。
水晶
碧玺的颜色为各类宝石当中最为丰富的，因为碧玺所含的化学成分较为复杂，其中的金属离子可以相互影响，故而造成了碧玺颜色和种类的差异。水晶的颜色以白色为主，也有粉色、紫色、蓝色等颜色，对于水晶颜色最高的评价是明艳动人，无杂色。
碧玺
碧玺受热具有压电性与热电性，因摩擦或日光照射会产生电荷，具有吸引异性电荷的能力，可以吸附灰尘纸屑等物质。水晶具有压电性，受到压力时水晶会产生电荷，而受到电压作用时会产生很高的频率震动，因此水晶具有让压力与电荷互相转换的性能。
水晶
碧玺的硬度较高，摩氏硬度在7~8左右，用坚硬的物体在碧玺表面轻轻一划，不易留下划痕。水晶的摩氏硬度在7左右，没有碧玺的硬度高，用坚硬的物体划过水晶表面，比较容易留下划痕。
